藏书印作伪都不是独立进行的，多为配合其他方式方法伪造版本，所以辨别其真假也可以结合多方面综合考虑。
第一，参考所钤文献相关内容判断：看书版式、字体、避讳、纸张、墨色与藏书印反映出来的年代是否相符;看书前书后关键部位有无割板拼接痕迹。伪钤藏书印之书，盖为纸墨精良、刻工隽秀之本，可比宋版。且多半于卷前书后、目录、序跋之处，同时伪刻前朝刻书时、地、人。若采用割去原板，补接半叶等作伪方式来作伪，则字体差异较大，用心考究，必能分清作伪之本。
如清华图书馆所藏抄本《李元宾文编》中钤有“翰林院印”，似乎是清初或者更早的本子，但此书中遇“玄”、“泫”、“弘”、“胤”诸讳字时避时不避，避则缺末笔。抄工简陋，字亦粗鄙，且多用简化字，无论用纸和字体风格，全然不是明抄本风貌。由避讳不严可知，此本至少是清末抄本，既是书商有意作伪，抄写时代甚或更晚。那么清末抄本中根本不可能钤此作为四库底本唯一证据的“翰林院印”关防，此印伪作无疑。
再如《枝山野记》一书上“翰林院印”与“凝晖堂”印部分重叠，“凝晖堂”为清代光绪间俞钰的堂号，俞氏不可能得到此珍贵的进呈本后在“翰林院印”上加盖自己的藏书印。显系“凝晖堂”印钤在前，众所周知，“翰林院印”只能钤于首页上端正中，所以造伪时只能令其叠钤在一起。如此，光绪年间以后的不可能是真的四库进呈本了。此印真伪立判。
第二，如果是仿造名家藏书印，则可找到其人所钤真印鬼畜眼镜，直接对比乔若熙，真伪立现。“乾隆御览之宝”也有伪作，单独钤印，不易发现其假。故宫博物院图书馆、北京图书馆、南开大学图书馆等地方所藏有《钦定四库全书总目》，都是明黄缎子封套，纸张、抄写无一不精，书中特定位置钤印“乾隆御览之宝”，故皆定为乾隆时内府精抄进呈本。然经过对照各本所钤之“乾隆御览之宝”，最后发现，只有一本上乾隆印是真品，其余皆为赝鼎。古代信息不流通，仅靠个人力量，单凭记忆，很难记住仿刻的藏书印与真印之间的细微差别。如清华大学图书馆的刘蔷经过比对馆藏的诸种古籍中钤印的“翰林院印”，发现“真者长宽尺寸均为10.35厘米，外廓宽0.95厘米，因系金属材质而四边轮廓清晰;印文方正而严整，凤凰传奇组合笔划筋骨分明;印泥为内府特制，印色朱红而明净，均匀并较少走油现象。伪者尺寸为10.9厘米见方，外廓宽1.1厘米，上下略有不均，四角或有缺损;印文略显模糊，笔划或有中断之处;印色浑暗，印泥絮绒紊乱，且走油严重。伪印押钤也如雕版刷印“初”、“后”一样有所差别，钤于《枝山野记》者奏刀刻石前磨制平整印面的划痕尚在，但对比钤于《李元宾文编》的一方缺损处完全一致，应是同一方伪印。现代网络技术发达，信息资源丰富，可以多方借鉴。比如上文所列真假“广运之宝”、“赵氏子昂”、“天水郡图书印”。前期也有不少关于藏书印的成果出来，比如《国家图书馆藏书印选编》一部十册、《明清著名藏书家藏书印》、《中国藏书家印鉴》、《明清藏书家印鉴》等都有图可资对比。
一般来说，伪印印质都较差，有的是木制的，仿刻的技巧也很拙劣。比如，清代著名的校勘家陈鳣的“仲鱼图像”印，真印中陈鳢端庄凝神，胡子紧密而不乱。沈津数十年间曾见过有六种翻刻的伪印，有的竞将老者陈鳣刻成眉清目秀的模样。“上个世纪的七十年代中，我(指沈津)在上海古籍书店选书时，在一本近人的印谱中还见到一方，图像中陈鳣的胡子稀疏可数，更是近人翻刻的。另一方刻着‘得此书，费辛苦。后之人，其鉴我’。这种伪印和真印相比，大相径庭，其膺立马能辨。”因伪印据真印翻刻，因此笔划较之真的要粗肥一些。如劳格的印，真伪印章的区别在“格”字上就能看出来。真印“格”字为细朱文，假印的“格”字相比笔划就粗肥些。劳格的伪印是木刻的窦文博，印质不同宋大德，也使印文笔画的效果发生了变化。当然，伪印也有仿刻得逼真的，像明末清初常熟毛晋汲古阁的印章，有一方为“汲古主人”，真印和伪印比对，仅“人”字的末笔稍有区别大唐2006，如果不多看真印，不多加比对，是容易上当的。
上图别是元代赵子昂和清代林皋所刻藏书印的伪作。“赵氏子昂”的伪作太过拙劣，一看即知假印。“天水郡图书印”着力模仿原作，也仅仅形似而无神韵。林皋的“杏花春雨江南”六个字，为仿王莽的悬针篆，每个篆字的竖笔都是纤细如针垂直悬挂。笔画末尾针尖，令人越欣赏楚奇楚童，感觉越有精神。而伪作的那方印，六个篆字线条不流利，尤其是“春”“江”两字。其字形略有点似悬针篆，但篆字风格及精神全失。
做古籍整理工作，平时应该多留心相关信息，并进行系统地收集整理，以备不时之需。但要注意同一方藏书印，在捺按时可能因用力不同，盖出来的效果略有差异;且长久使用后，藏书印本身会有磨损，钤盖后印面也会有细微差别，主要表现在笔划的粗细、字迹的清晰、边框的时断时续等处。
第三，直接利用经验就藏书印本身来判断：看藏书印章的篆法、印泥的颜色等是否拙劣。藏书家对自己珍藏之书爱惜有加，所钤之藏书印也必是精雕细琢，字体优美，或丰神流动、或庄重典雅，字里行间疏密有度、布局合理邢良坤。如果古籍中钤有名人的藏书章，却刻字恶劣，印泥不佳，钤盖累累，不择位置，则亦需留心鉴别。伪印一般字体拙劣，呆板乏味。
如果一书之中有数个藏书印，则可以细心观察，各个藏书印印泥颜色是否相同。古代官府藏书印多用水印，私家藏书印明代皆用油印，清代也以油印居多镇天帝道。印油为硃砂与油混合制成，每位藏书家所用印油会因硃砂比例不同，颜色差异较大，不可能完全相同颠沛流离造句。但相同的是颜色鲜艳雅致，经久不褪。而书贾作伪之印，印泥劣质，时间稍长，往往由鲜红变成绛红，颜色暗淡无光。一望即知有假。叶云凤
不同时期的藏书家的印章钤盖位置和顺序也要多加注意。古人在藏书上盖章是有大讲究的，印章最多的地方是目录及每卷的第一页和最后一页中空白的地方、序跋后空白的地方。位置一般是在边栏内，也有因为行款太密容不下，才盖至栏外。若一位藏书家在栏内钤有名号章，则天头处所盖的藏书印多为室名章。官府藏书印除外，为了显示其至尊地位，官府印章往往在固定位置钤章。如清代乾隆的套印、“翰林院印”、“学部图书之印”等，无论有字无字，都居于书籍首页上部正中。规范的第一个藏书印盖于右数第一行下方的空白处，若此处无空，则左移。第二个印章应该盖于第一个印章上方的空白处战妻，若其上方无空，则左移至最下方的空白处。依次从下至上，从右至左在空白处钤盖。研究藏书史的学者常常说通过藏书印可以探究文献的流传顺序也是因此得出。书贾作伪时往往囿于知识所限，将不同朝代不同时期的藏书家的数方印章胡乱钤盖，或者于不知名藏书家的真印缝隙中加盖伪作名家藏书印，致使诸藏书印钤盖顺序大乱，行家稍加推导即知真伪。
内府及权贵之家的藏书印断风贤，则可据藏书品种与级别辅助判断。他们所藏图书字画多系珍品朴政玟，用印比较讲究。碰到这类印章，需认真推敲。
第四，用最直接的方式是反过去查藏书印主的藏书目录田中飞妈。此种方法用来辨别早期名家藏书印被后人盗用最有效果玛德莱克丝。钤真印于晚出之书，虽是作伪，但印为真印，从印章本身的篆刻着手难以辨别，与真印对比这种方法更不可能奏效。几可乱真的笔描藏书印也只能以此种方式去辨别，以书目著录印证原书是否为名家所藏，真伪立现。此法虽好用，但也并非每方伪印皆能辨出结果，因为藏书家的数量可谓多如繁星，而编有藏书目录的却是寥寥可数。